福建省中医药研究院创建于1957年，系省属公益类中医药科研院所，位于福州市鼓楼区五四路282号。主要开展中医药基础与临床研究，承担新药的临床研究工作，开发山海药物资源，开展中医药的对外交流等工作。是国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、福建省青草药开发服务中心、福建中医药大学保健食品研发中心。

院内设经络研究所、药物研究所、基础研究所、临床医学研究所、科技产品研发中心、中医药技术转移中心、比较医学中心等，并附设综合门诊部、福州三利得营养保健品厂、职业技能鉴定站、台湾牛樟芝大陆研发中心及台湾产特色植物大陆研发中心等。

现有职工205人（含离退休），其中高级职称专业技术人员78人，拥有一批国务院特殊津贴、国家级和省级名老中医学术继承人指导老师、省级突出贡献中青年专家、省名中医等。

研究院现有1个国家中医药管理局重点研究室、1个国家中医药管理局三级实验室、1个科技部 中药及健康产品研究开发专业技术服务平台 、15个省级各类重点实验室、研究室、基地及工程技术研究中心。

至2017年底，共完成科研课题700多项，先后取得201余项各类科研成果和奖励，其中国家级7项，省部级69项；发表科研论文2600多篇,编写书籍160余部；获得国家授权的各类专利14项。